我院男科与性医学科是我国少数、福建省首家集医疗、教学、科研为一体的男科与性医学专业学科。是中国男科医师培训（福建）基地、中国性学会性学研究福建中心、福建省医学会男科学分会等挂靠单位、中国男性不育联盟发起单位、国家临床药物实验基地。全面开展男科与性医学科疾病的基础研究与临床诊疗，开展的复杂手术和特色治疗居国内领先水平，包括：显微镜下的精索静脉结扎术、输精管-附睾或输精管吻合术、睾丸切开取精术；经尿道的精囊镜术、射精管切开术、保留性功能的前列腺电切术；注重功能与整形的男生殖器畸形与创伤手术等，年门诊量、住院量、手术量、学术和医疗水平等均位于国内、省内领先。